Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem88Q9D0N8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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