Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms