Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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