Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms