Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prps2Q9CS42 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms