Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PompQ9CQT5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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