Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms