Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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