Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms