Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg3Q9CPX6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atg3Q9CPX6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms