Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sike1Q9CPR7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms