Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp1b4Q99ME6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms