Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rab28Q99KL7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rab28Q99KL7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rab28Q99KL7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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