Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms