Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q8VDP2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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