Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fam20bQ8VCS3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam20bQ8VCS3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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