Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc4a8Q8JZR6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc4a8Q8JZR6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Slc4a8Q8JZR6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Slc4a8Q8JZR6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc4a8Q8JZR6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms