Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbm28Q8CGC6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rbm28Q8CGC6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rbm28Q8CGC6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rbm28Q8CGC6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rbm28Q8CGC6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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