Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc28bQ8CEG5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28bQ8CEG5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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