Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppfibp1Q8C8U0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms