Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmod1Q8BVA4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms