Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nop53Q8BK35 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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