Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Htatsf1Q8BGC0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Htatsf1Q8BGC0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htatsf1Q8BGC0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms