Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Zbed4Q80WQ9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zbed4Q80WQ9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Zbed4Q80WQ9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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