Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc88cQ6VGS5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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