Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mfsd13aQ6PDE8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mfsd13aQ6PDE8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms