Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
NipblQ6KCD5 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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