Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt40Q6IFX3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms