Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scaf8Q6DID3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms