Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Msl2Q69ZF8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msl2Q69ZF8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Msl2Q69ZF8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Msl2Q69ZF8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Msl2Q69ZF8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Msl2Q69ZF8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Msl2Q69ZF8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Msl2Q69ZF8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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