Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CltcQ68FD5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms