Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col4a5Q63ZW6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms