Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sin3bQ62141 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sin3bQ62141 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sin3bQ62141 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sin3bQ62141 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sin3bQ62141 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sin3bQ62141 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sin3bQ62141 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sin3bQ62141 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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