Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim25Q61510 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim25Q61510 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim25Q61510 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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