Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CttnQ60598 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms