Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms