Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Trappc1Q5NCF2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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