Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ankrd28Q505D1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ankrd28Q505D1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ankrd28Q505D1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ankrd28Q505D1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ankrd28Q505D1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ankrd28Q505D1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ankrd28Q505D1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ankrd28Q505D1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ankrd28Q505D1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Ankrd28Q505D1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ankrd28Q505D1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ankrd28Q505D1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ankrd28Q505D1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ankrd28Q505D1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ankrd28Q505D1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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