Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pacs2Q3V3Q7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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