Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fchsd2Q3USJ8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fchsd2Q3USJ8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms