Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc33Q3ULW6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc33Q3ULW6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms