Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc9Q3U0M1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms