Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rufy4Q3TYX8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rufy4Q3TYX8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rufy4Q3TYX8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rufy4Q3TYX8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rufy4Q3TYX8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rufy4Q3TYX8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rufy4Q3TYX8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rufy4Q3TYX8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rufy4Q3TYX8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms