Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp39Q3TIX9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp39Q3TIX9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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