Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Perm1Q149B8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms