Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VgfQ0VGU4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms