Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ttc39dQ0VF76 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ttc39dQ0VF76 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ttc39dQ0VF76 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ttc39dQ0VF76 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ttc39dQ0VF76 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttc39dQ0VF76 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ttc39dQ0VF76 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ttc39dQ0VF76 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ttc39dQ0VF76 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ttc39dQ0VF76 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Ttc39dQ0VF76 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttc39dQ0VF76 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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