Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc21bQ0HA38 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc21bQ0HA38 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms