Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PrcdQ00LT2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms