Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbp4Q00724 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms